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Embark有方博雅应用数学类利用单细胞真核生物特性寻找染色体断裂
发表日期:2019-05-02 21:10| 来源 :本站原创 | 点击数:
本文摘要:原题目:Embark无方博雅使用数学类操纵单细胞真核生物特征,寻找染色体断裂的信号 生物消息学是一门交叉学科,它将计较机手艺、统计学方式以及数学算法等使用到生物学研究傍边。这门学科的发生也是一种必然趋向,终究测序手艺成长那么快,分子生物学和遗传生

  原题目:Embark无方博雅使用数学类操纵单细胞真核生物特征,寻找染色体断裂的信号

  生物消息学是一门交叉学科,它将计较机手艺、统计学方式以及数学算法等使用到生物学研究傍边。这门学科的发生也是一种必然趋向,终究测序手艺成长那么快,分子生物学和遗传生物学的消息量爆炸式增加。

  举个简单的例子来说此刻随便一个测序至多6个样本,每个样本3万个探针消息,全球那么多人做测序,这消息量就跟海一样,生物消息学就是为了把这海变成湖,变成池塘。

  另一方面,遗传学本身的消息量就很大,好比人类基因组有30亿对碱基,2.5万的基因,所以生物消息学的一个主要使用就是成立各类各样的数据库,来实现消息共享,终究一小我穷尽终身的精神可能也就研究几个基因,可是全球这么多人配合勤奋,这2.5万个基因就变得不那么难了。

  因为处理的是生物学问题,会涉及到遗传学,即研究生物体的遗传和变异的学科;分子生物学,即对生物学在分子层面上的研究;进化生物学,即研究生命演化的学科。

  【基因组中的染色体断裂信号】

  我们将会一路来研究一种风趣的现象:基因组重排 (genome rearrangement)。基因组并不像我们所想象的那样是一个不变的布局,现实上从转座子(Transposon, 诺贝尔奖1983, Barbara McClintock)的发觉起头,我们就晓得基因组是一个动态的,能够变化的布局。多出一个拷贝片段,删除,或者是倒置,转移,都是常常发生在基因组里的工作。

  天然界良多真核动物在发育过程中,要履历他们“成长”所必需的基因组重排,好比七鳃鳗(lamprey),会需要删掉本人生殖细胞基因组的90%来获得一个成熟的体细胞基因组。而另一方面,紊乱的基因组重排,是激发疾病的环节要素,好比在癌症细胞中,我们能够察看到大量的基因组重排。那么,基因组为什么要断裂,又是若何从头毗连的呢?这个课题我们将聚焦在断裂的问题上。我们会用一种单细胞真核生物Euplotes作为模式生物,它们是纤毛虫的一种,有着令人瞠目结舌的基因组布局和重排。我们将在它的基因组里寻找染色体断裂的信号。

  生物:要求领会根基的遗传学和生物学学问

  英文:要求有极好文献阅读能力,每周会有文献阅读,这是生物进修必不成少的一环。

  计较机:能够没有根本,可是若是有任何言语的根本,会比力容易一些

  生物学 – 分子生物学、进化生物学

  计较机 – 机械进修、编程

  统计学 – 宏观经济学,微观经济学,计量经济学

  哥伦比亚大学 计较数学博士

  北京大学 本科

  持久担任哥大研究生助理,处置范畴内研究长达数年,具有丰硕的讲授科研经验。

  哥大在2017年美国旧事与世界报道(US News & World Report) 公布的美国大学排名中位列第5 。2016-17年度,哥大位列ARWU世界大学学术排名世界第9。

  【课程模块一:准备课程】

  在讲授过程正式起头前,无方学者会按照学生的具体环境供给微积分、统计、和英语学术论文写作等准备课程

  【课程模块二:科研教导】

  8-12周的科研教导:

  1、领会纤毛虫的生物学特征,领会为什么选择它作为模式生物。

  2、领会基因组测序手艺。若何从细胞中提取DNA。

  4、领会若何获得一个基因组(genome assembly)。以及目前通用的计较机软件来实现基因组建立。

  5、用计较生物学东西评估一个基因组的质量和完整性。用quast来评估基因组的质量。

  6、进修写简单的python来研究一个纤毛虫基因组。

  7、完成学术论文综述和纲领的写作,并向科研团队进行答辩

  *指点速度可能因现实讲授环境而异

  【课程模块三:论文写作&颁发】

  1:项目导师将教导学生完成论文写作

  2:协助学生完成论文在英文学术期刊上正式颁发。

  整个科研讲授流程中,每一位学员都将有学术督导协助保障研究阶段性功课和论文的进度,确保取得研究功效。

  1、获得美国顶尖高中才能具有的教育资本

  2、接触最前沿的科研项目与顶尖的科研团队指点

  3、获得来自美国top30高校研究团队的保举信

  4、以独立第一作者身份将论文颁发于英文学术期刊

  无方学者项目标参与者可以或许获得美国顶尖高中才能具有的教育资本,在高中阶段就可以或许接触最前沿的科研项目与顶尖的科研团队,获得博士高质量的特地指点,在具体范畴达到专业研究人员水准。

  本项目课题研究仅限2个名额

  注:本课程采纳审核制招生,我们将通过两轮面试评估课程婚配度,最终确定入选的学生名单。

  本项目适合适合申请STEM专业标的目的:计较机、经济、金融等相关专业的学生。

  合适以下前提的学生皆可申请参与此项目:

  就读 9-11年级学生

  有必然的英语阅读和写作能力

  有较强的逻辑思维和笼统思维能力

  专业范畴的零根本学生,我们会供给相关的学术学问培训。

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(责任编辑:admin)
http://dxsjwj.com/rst/586/
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